1、名称不同。不动产权证和房产证最大的区别就是名称不同，房产证全称为中华人民共和国房地产权证；不动产证全称为中华人民共和国不动产权证书。

2、内容不同。房产证和不动产证在内容上就有很大的区别：房产证包含房屋所有权人、共有情况、房屋坐落、登记时间、房屋性质、规划用途、房屋状况和土地状况；而不动产权证对比房产证增加了镭射区、不动产单元号、适用期限等内容。

3、发证机关不同。不动产权证和房产证的发证机关不同，房产证印章：发证机关是市（县）房地产管理局（房产管理局）或市（县）人民政府。不动产权证印章：不动产登记机构由县级以上人民政府依法确定的、统一负责不动产登记工作的部门，如：“XX县国土资源局不动产登记专用章”。

法律依据：

《不动产登记暂行条例》第四条 国家实行不动产统一登记制度。不动产登记遵循严格管理、稳定连续、方便群众的原则。不动产权利人已经依法享有的不动产权利，不因登记机构和登记程序的改变而受到影响。

第五条 下列不动产权利，依照本条例的规定办理登记：

（一）集体土地所有权；

（二）房屋等建筑物、构筑物所有权；

（三）森林、林木所有权；

（四）耕地、林地、草地等土地承包经营权；

（五）建设用地使用权；

（六）宅基地使用权；

（七）海域使用权；

（八）地役权；

（九）抵押权；

（十）法律规定需要登记的其他不动产权利。