1、两者的行为目的不同。民间借贷行为的指向性明确，往往是用于生产经营等特定的急需资金的目的，而非法吸收公众存款的行为人其目的虽是通过货币运营等金融手段获取利润，但资金使用方向并不明确。2、两者的行为对象不同。民间借贷的对象有特定的范围;而非法吸收公众存款行为针对的是社会不特定的对象，其往往通过宣传、介绍、许以高额回报等手段诱使社会公众基于增值货币的愿望出让资金，扰乱了国家金融秩序、违反了金融监管制度。3、两者的利率合法性不同。民间借贷一旦发生纠纷，借贷双方约定的利率超过年利率36%，超过部分的利息约定无效。而非法吸收公众存款行为许以的高额回报不受法律保护。